《ABX指南:感染性疾病的诊断与治疗(第2版)》分为五部分，即：诊断，病原体，治疗，药物治疗和疫苗。每一部分为了便于快速查找是按照字母顺序编排的，每一个单元采用共同的顺序、结构以及注解参考。第一部分，诊断。包括诊断标准、常见的病原体、预防、以及包括辅助治疗在内的完整治疗原则。第二部分，病原体，主要以纲来分类，包含了与临床相关的病菌、感染部位和根据感染部位的治疗方法。对于本版来说，新增的“治疗”，是关于在鉴别诊断和治疗中如何利用建议处置相同的症状。第四部分，药物，其中抗感染药包括药、抗真菌药、抗寄生虫药、抗病毒药和生物制剂。每部分的范围由适应证、剂量和剂量调整、药物相互作用、妊娠期和哺乳期用药信息、重要的注释和药物相关的图表、商品名。给药途径和预计的价格。第五部分，疫苗，罗列了常见疫苗、诊断标准、治疗原则和重要的临床观点。